ശ്രീ ശങ്കരാചാര്യർ തന്റെ പ്രസ്ഥാനത്രയ ഭാഷ്യങ്ങളിൽ (ബ്രഹ്മസൂത്രം, ഉപനിഷത്തുകൾ, ഭഗവദ്ഗീത എന്നിവയുടെ വ്യാഖ്യാനങ്ങൾ) പ്രധാനമായും ശ്രുതികൾക്കും (ഉപനിഷത്തുകൾ) സ്മൃതികൾക്കും (ഭഗവദ്ഗീത, മഹാഭാരതം) ആണ് മുൻഗണന നൽകിയിട്ടുള്ളതെങ്കിലും, ചില പുരാണങ്ങളെയും അദ്ദേഹം പ്രമാണമായി ഉദ്ധരിച്ചിട്ടുണ്ട്. അദ്ദേഹത്തിന്റെ ഭാഷ്യങ്ങളിൽ പ്രധാനമായും പരാമർശിക്കപ്പെടുകയോ ഉദ്ധരിക്കപ്പെടുകയോ ചെയ്യുന്ന പുരാണങ്ങൾ താഴെ പറയുന്നവയാണ്: വിഷ്ണുപുരാണം (Vishnu Purana): ശങ്കരാചാര്യരുടെ ഭാഷ്യങ്ങളിൽ, പ്രത്യേകിച്ച് ബ്രഹ്മസൂത്രഭാഷ്യത്തിലും വിഷ്ണുസഹസ്രനാമ ഭാഷ്യത്തിലും ഏറ്റവും കൂടുതൽ തവണ ഉദ്ധരിച്ചിട്ടുള്ളത് വിഷ്ണുപുരാണത്തിൽ നിന്നാണ്. വായുപുരാണം (Vayu Purana): പ്രപഞ്ചസൃഷ്ടി, കാലഗണന എന്നിവയുമായി ബന്ധപ്പെട്ട ചർച്ചകളിൽ വായുപുരാണത്തിലെ ശ്ലോകങ്ങൾ അദ്ദേഹം പരാമർശിക്കുന്നുണ്ട്. മാർക്കണ്ഡേയപുരാണം (Markandeya Purana): ജീവന്റെ അവസ്ഥകളെയും പ്രപഞ്ചഘടനയെയും കുറിച്ചുള്ള ചില ഭാഗങ്ങൾ വ്യക്തമാക്കാൻ മാർക്കണ്ഡേയപുരാണത്തെ അദ്ദേഹം ആശ്രയിച്ചിട്ടുണ്ട്. ശിവപുരാണം / ലിംഗപുരാണം (Shiva Purana / Linga Purana): ശിവന്റെ മാഹാത്മ്യത്തെയും തത്ത്വങ്ങളെയും കുറിച്ചുള്ള ചില പരാമർശങ്ങൾ ശങ്കരഭാഷ്യങ്ങളിൽ കാണാം. പദ്മപുരാണം (Padma Purana): പദ്മപുരാണത്തിലെ ചില ഭാഗങ്ങളും അദ്ദേഹത്തിന്റെ വ്യാഖ്യാനങ്ങളിൽ സൂചിപ്പിക്കപ്പെടുന്നുണ്ട്. മറ്റു പ്രധാന സ്മൃതി/ഇതിഹാസ ഗ്രന്ഥങ്ങൾ: പുരാണങ്ങൾക്ക് പുറമെ മഹാഭാരതത്തിന്റെ ഭാഗമായ ഹരിവംശം (ഇത് പലപ്പോഴും ഒരു ഉപപുരാണമായി കണക്കാക്കപ്പെടുന്നു), സനത്സുജാതീയം, മനുസ്മൃതി തുടങ്ങിയ ഗ്രന്ഥങ്ങളിൽ നിന്നും അദ്ദേഹം വിപുലമായി ഉദ്ധരണികൾ നൽകിയിട്ടുണ്ട്. അതേസമയം, ഭാഗവത പുരാണത്തെ (ശ്രീമദ് ഭാഗവതം) കുറിച്ച് ശങ്കരാചാര്യരുടെ ആധികാരിക ഭാഷ്യങ്ങളിൽ നേരിട്ടുള്ള പരാമർശങ്ങൾ കാണാനില്ല എന്നത് ശ്രദ്ധേയമാണ്.